Кайенский перец относится к семейству паслёновых, в составе которого имеется несколько видов, которые довольно сильно отличаются между собой.

Некоторые виды являются многолетними кустарниками, достигающими размеров одного метра высотой, причём разные подвиды разнятся своими плодами, которые могут отличаться формой и цветом. У некоторых форма напоминает плоды стручкового перца, но по размеру они гораздо меньше. Кроме того, у них другая окраска плодов, имеющая светло-оранжевый или жёлтый цвет. Форма плодов может быть самая разнообразная: вишенка, оливка, похожие на сердечко или в форме птичьего языка.

Другая разновидность кайенского перца является травянистым растением однолетником, которое имеет прямостоячий ветвистый стебель, на котором расположены черешковые или длинночерешковые листья, имеющие форму продолговато-яйцевидную с заостряющейся верхушкой.

Размеры растения по высоте не превышают шестидесяти сантиметров. Цветки у растения белого цвета поникающего вида, период цветения с июня по август, плодоношение кайенского перца происходит с августа по сентябрь.